官员进行年终考核。
督察院和六科给事中两个部门互相牵制，互相监督，不仅使监察机构的权力受到制约，对监察制度本身，也起到了维护的作用。
大理寺
中国古代掌管平反狱刑的官署。朱元璋于1367年置大理司卿，为正三品。
主要职责：审核天下刑事案件，有量刑不当的，要依据法律重新裁定，有错判误判的，要重新审理，不能放过罪犯，不能冤枉无辜。
刑部，督察院，大理寺合称三司法。刑部裁定，定罪，督察院调查，大理寺有权驳回，有重大案件，都要三司法会审。初审以刑部，督察院为主，复审以大理寺为主，如未经大理寺允许，犯人不得发配入狱或流放。
朝迁特派员
由皇帝选派亲信，大臣，代表皇帝到各个行省，地方，定期或不定期的进行巡查，并将情况如实回报给皇上。
翰林院
是明代通过科举考试汇集人才的地方，也是明代高层政治人物的输出之所。虽然翰林院不过是一个五品衙门，尚不如一个地方的府级单位，但其政治上的特殊性和重要性，绝不是其他部门所能比肩或代替的，尤其在人才的培养和储备方面具有特殊功能。翰林学士为正三品，他们并不参与实际的行政工作，一般只是负责教授皇室子孙，修编国史，帮皇帝起草文案。而且，只有翰林学士才能进入内阁，六部尚书及侍郎大部分都出身自翰林院。
翰林院的设立，反映了明代政府对政治人才，尤其是高层政治人才培植的高度重视和用心经营。
国子监
是明代国家管理教育的最高行政机构和国家设立的最高学府。掌管全国学生的教育。
二十四衙门（宦官机构）
主要有十二监，四司，八局。负责照顾皇帝及其后宫，子女起居饮食，以及皇宫内部的大小事宜。他们分工详细，责任明确。
厂卫制度（特殊的特务机关）
东厂，西厂，内行厂――由宦官组成，专门从事侦缉活动，并行事审判权。他们人数众多，形成了以京师为中心的全国性特务网，权力很大。
锦衣卫――由保卫皇帝安全的侍卫组成。朱元璋为了有效的控制臣民，赋予锦衣卫侦察，逮捕，审讯等司法权，并直接对皇帝负责。大理寺和刑部不得过问其审判活动。
由于厂卫制度是受皇帝指使的法外司法机关，具有独立的审查，缉捕，审讯权，不受法律和司法程序约束，破坏了正常的司法制度，导致了封建法制的紊乱，反映了司法制度的畸形发展，也表现出君主专制制度的腐朽，没落和残酷。
军权－五军都督府
朱元璋为分散中央军事机构的权利，撤销大都督府，改设前，后，左，右，中，所谓的五军都督府，并规定五军都督府管兵籍，掌军政，但无调动军队的权力。
兵部掌管军官的选拔和军令，但无直接指挥军队的权力。
这样，兵权也完全掌握在了皇帝手中。
地方官制
明代地方区域划分为省，府，县三级。除北京，南京外全国被划分为十三个省，分别是浙江，江西，福建，北平，广西，四川，山东，广东，河南，山西，陕西，湖广和云南。
元朝时在各省设置行中书省，掌管该省的政，法，军权，号称“外政府”。因此造成各省各自为政，擅权自专，不听朝廷调度，形成分裂割据局面。朱元璋吸取前朝教训，废除行中书省，改在各省设：
承宣布政使司－主管一省的民政和财政
提刑按察使司－主管一省司法刑狱，诉讼事务，同时也是中央监狱机关督察院在地方的分支机构，对地方官员行使监督权。
都指挥使司－明政府设立于地
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