船被后世称为红色女娲神石，也就是辰云本体的一块磁欧石击中，而坠毁在后世亚洲地区。
同年，位于百慕大地区的海底实验室也遭到了毁灭性打击。众人分崩离析后只有作为其中央电脑程序员的波塞冬幸存下来，但是却发现自己因为实验室内的生化药物，而造成身体变异。
随后几年，波塞冬在其身体完全变异之后设计出一个人工智能，取名：扎尔西斯。
在扎尔西斯被波塞冬设计出后十几年，想得到真实人类身体的扎尔西斯杀死了波塞冬，而被算计到这一步的波塞冬暗中留下的后门程序让其制造出自己的一个克隆程序：莫费里奥。
公元前一万年乃至更前，从诺亚号飞船的休眠系统里醒来的伏羲女娲兄妹，发现世界已经完全变样，而两人也选择了截然不同的两条道路。
随后几年，伏羲想制造世界机器回到磁欧石爆炸前夕，结果失败身亡。其灵魂被其作为能源的一块蓝色磁欧石吸收，而诞生了日后的风尊。
同年，女娲利用诺亚号飞船内的生物培养系统，成功让一批大爆炸幸存下来的类人猿拥有了初步的智力。
数年之后，一块小行星般的陨石因为被磁欧石爆炸而改变了磁场的地球吸引，就要撞击地球。被女娲用所能找到的剩下的五块最大的磁欧石碎片作为能源的机器炸毁，但是负荷过大的机器爆炸，女娲牺牲。
剩下的五块磁欧石碎片因为爆炸分崩离析，就是后世所说的女娲神石。
公元前四千五百年，诺亚号飞船内的矿石采集器因为磁欧石影响而产生智力，受到诺亚号飞船内主程序的影响，变成一个杀戮机器：蚩尤。
同年，被蚩尤杀戮的苦不堪言的轩辕和炎帝举行祭祀，而被他们手里的磁欧石影响，从冥府之界回到现世的玄辰雨和姜梦蓝穿越时空来到这个时代。
同年，消灭掉蚩尤的玄辰雨和姜梦蓝乘坐伏羲制造的时间机器离开，回到属于自己的时代。
1965年，还是青年的玄云尚和叶秋（玄辰雨的爷爷奶奶）发现了一块白色女娲神石。
1967年，叶秋诞下一子，就是体内有白色女娲神石的玄奕
1987年，玄云尚和玄奕在王石村后山祖祠堂发现了昏迷的梅馨。
1988年，姜林在昆仑山遇到狐香和狐玉。
1990年，主角玄辰雨诞生。
1991年，玄奕和梅馨为了救治先天阳亏之体和没有心脏的玄辰雨，而盗取了王石村内供奉的红色女娲神石，并将其融入玄辰雨胸口内心脏部位。
同年，带人追上他们的玄云尚被风尊控制的玄辰雨大伯玄鸿暗算身亡，风尊现身。
同年，为了保护玄奕和玄辰雨，梅馨意图与风尊同归于尽，但是失败魂魄破碎。一片魂魄和海伦与斩邪内附着的夭夭魂魄融合成新个体。
同年，回到王石村的叶秋和玄奕，发现风尊控制玄鸿尸体，冒充玄鸿而将两人通缉。无奈之下二人只好开始不断躲避王石村的追捕。
1996年，五岁的姜梦蓝和母亲狐玉在后山被恶鬼袭击，狐玉身死。姜梦蓝也留下了寒毒的病根。
2008年，主角被风尊派遣的灵卒找到，而知道了自己的不同寻常。
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